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发酵罐有封闭式和开放式两大类，所谓封闭式体系是指该体系在发酵过程中没有物质添入或从发酵罐取出，因之在传统的分批或封闭发酵体系巾，所有营养成分在发醉开始时一次投入，其结果是在该体系中生物的生长速率因为在发酵过程中营养成分的逐渐消耗或有害物质的逐渐积累后递减到零.正因为这个原因在封闭式发酵过程中生物的谢总是处于不断变化着的状态。目前大多数生物工程过程是以这种方式进行的，故使其条件佳化以期获得所需产品的大产量，啤酒酿造，杭菌素和酶的生产等等即属此类。

工业生产用的发酵大小围可以从10000升到200000升，巨型的400000。升的反应器近也已投入使用。

较小的发酵罐主要用于价格昂贵、体积小的产品，如某些酶类和化学试剂。而较大一些的发酵罐则广泛用于生产素和酸等。

对分批发酵的改进是分批填料体系，大量营养物质可以在发酵过程中添加进去，以补充营养的消耗或者起合物的选择性激活剂的作用，面包工业的酵母生产即是这方面的例子。不过体系还是封闭式的，因为并没有连续性的物质流出.

与此相反的是，如果一个发酵体系的所有成分，如生物和营养物质能不停地进入发酵罐和离开发酵罐，则称之为开放式体系。这种开放式的连续流动的发酵体系，不断地有新鲜营养物质输入，并不断地有生物量或其他产品输出。

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